期刊简介

本刊隶属于中华预防医学会系列杂志。 “以防为主(三级预防),防治并举”为本杂志的办刊宗旨。主要栏目有流行病学与预防医学、基础研究、临床研究、综述与讲座、技术革新与经验交流、论著摘要与病案报道、域外肿瘤研究信息转载、简讯等。为活跃学术气氛,增加著、读、编者间的交流,本刊还将不定期的设置“学术争鸣”栏目。本刊以从事肿瘤基础研究与临床工作者以及大专院校师生为主要读者对象。

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  • 杂志名称:中华肿瘤防治杂志
  • 主管单位:齐鲁肿瘤杂志;肿瘤防治杂志;当代肿瘤学杂志
  • 主办单位:国家卫生和计划生育委员会
  • 国际刊号:11-5456/R
  • 国内刊号:11-5456/R
  • 出版周期:半月刊
期刊荣誉:中国期刊方阵来源刊 ASPT来源刊 中国期刊网来源刊期刊收录:剑桥科学文摘, 上海图书馆馆藏, 国家图书馆馆藏, 医学文摘, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 万方收录(中), 哥白尼索引(波兰), 文摘与引文数据库, 知网收录(中), ASPT来源刊, CA 化学文摘(美), 维普收录(中)
中华肿瘤防治杂志2007年第14期

WDR45L大鼠同源基因编码区cDNA的克隆及生物信息学分析

王海涛;畅继武;郭志

关键词:生物信息学, 计算机克隆, 种属同源基因, WDR45L
摘要:目的:克隆肿瘤相关基因WDR45L的大鼠同源基因,并进行初步的生物信息学分析.方法:以人WDR45L同源氨基酸序列(CAJ57996.1)作为查询序列,利用TBLASTN和BLASTN软件搜索数据库中与大鼠WDR45L基因同源的cDNA和EST序列.把检出序列组装为连续体(Contig),在UCSC程序上进行EST连续体序列的拼接和基因组序列与EST序列的双重校对.克隆基因采用RT-PCR测序证实,并进行核酸与蛋白质特性的生物信息学分析.结果:综合利用基因组和EST序列信息成功克隆了大鼠WDR45L基因(GenBank登记号:AM182327和NM_001039587.1).RT-PCR测序结果与计算机克隆结果完全一致.生物信息学分析显示:WDR45L基因定位于染色体10q32.3区,含11个外显子和10个内含子,ORF为1 035 bp,编码344个氨基酸;在种属中高度保守;WDR45L基因在胃癌、结肠癌、乳腺癌、卵巢癌、肾癌和胰腺癌等恶性肿瘤中表达上调.结论:综合利用基因组和EST序列信息是更为科学的计算机克隆方法,进一步深入研究WDR45L基因的功能具有重要生物学意义.