期刊简介

本刊隶属于中华预防医学会系列杂志。 “以防为主(三级预防),防治并举”为本杂志的办刊宗旨。主要栏目有流行病学与预防医学、基础研究、临床研究、综述与讲座、技术革新与经验交流、论著摘要与病案报道、域外肿瘤研究信息转载、简讯等。为活跃学术气氛,增加著、读、编者间的交流,本刊还将不定期的设置“学术争鸣”栏目。本刊以从事肿瘤基础研究与临床工作者以及大专院校师生为主要读者对象。

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  • 杂志名称:中华肿瘤防治杂志
  • 主管单位:齐鲁肿瘤杂志;肿瘤防治杂志;当代肿瘤学杂志
  • 主办单位:国家卫生和计划生育委员会
  • 国际刊号:11-5456/R
  • 国内刊号:11-5456/R
  • 出版周期:半月刊
期刊荣誉:中国期刊方阵来源刊 ASPT来源刊 中国期刊网来源刊期刊收录:剑桥科学文摘, 上海图书馆馆藏, 国家图书馆馆藏, 医学文摘, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 万方收录(中), 哥白尼索引(波兰), 文摘与引文数据库, 知网收录(中), ASPT来源刊, CA 化学文摘(美), 维普收录(中)
中华肿瘤防治杂志2011年第19期

胰腺癌Panc-1细胞microRNA差异表达谱生物信息学的分析

单振兴;周小艳;李天亮;韩金祥;崔亚洲

关键词:胰腺肿瘤, 微RNAs, 基因表达谱, 计算生物学
摘要:目的:对胰腺癌细胞差异miRNAs表达谱进行生物信息学分析,以期从整体水平揭示microRNA在胰腺癌癌变和进展中的作用.方法:采用含有924条探针的microRNA微阵列检测胰腺癌Panc-1细胞,以3T3成纤维细胞为对照,筛选Panc-1细胞特异性microRNA表达谱;然后对上调和下调microRNA的靶基因进行Gene Ontology、Pathway和TFBS转录因子结合位点分析,以及构建microRNA和靶基因相互作用网络.结果:与3T3成纤维细胞的microRNA表达谱比较,筛选出9个Panc-1上调microRNA,20个下调microRNA.TargetScan和miRanda软件预测出1 166个microRNA靶基因在Panc-1细胞中上调,212个靶基因下调.以上靶基因在DNA代谢、细胞间信号和胞质溶胶3种GO中富集显著;靶基因共涉及50条信号通路,其中富集度P<0.05的信号通路有6条;转录因子结合位点分析表明,CEBP-β、NF-kB和p53等对于上调以及下调的microRNA可能都有调节作用;microRNA和靶基因的相互作用网络分析表明,HIF-1A等基因连接度高.结论:利用生物信息学方法对胰腺癌细胞microRNA表达谱进行数据分析,可以为进一步了解胰腺癌的发病机制提供新的思路.