期刊简介

本刊隶属于中华预防医学会系列杂志。 “以防为主(三级预防),防治并举”为本杂志的办刊宗旨。主要栏目有流行病学与预防医学、基础研究、临床研究、综述与讲座、技术革新与经验交流、论著摘要与病案报道、域外肿瘤研究信息转载、简讯等。为活跃学术气氛,增加著、读、编者间的交流,本刊还将不定期的设置“学术争鸣”栏目。本刊以从事肿瘤基础研究与临床工作者以及大专院校师生为主要读者对象。

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  • 杂志名称:中华肿瘤防治杂志
  • 主管单位:齐鲁肿瘤杂志;肿瘤防治杂志;当代肿瘤学杂志
  • 主办单位:国家卫生和计划生育委员会
  • 国际刊号:11-5456/R
  • 国内刊号:11-5456/R
  • 出版周期:半月刊
期刊荣誉:中国期刊方阵来源刊 ASPT来源刊 中国期刊网来源刊期刊收录:剑桥科学文摘, 上海图书馆馆藏, 国家图书馆馆藏, 医学文摘, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 万方收录(中), 哥白尼索引(波兰), 文摘与引文数据库, 知网收录(中), ASPT来源刊, CA 化学文摘(美), 维普收录(中)
中华肿瘤防治杂志2014年第02期

胃癌患病风险关键基因筛选

李龙;李静;黄东兰;郑燕芳;张积仁

关键词:胃肿瘤, 患病风险, 基因, 生物信息学
摘要:目的:筛选胃癌患病风险关键基因,为进一步相关性研究提供参考.方法:检索Pubmed/Medline和Embase数据库,收集胃癌患病风险相关基因的文献,运用生物信息学的方法对获得的基因进行分析.结果:954篇文献符合要求,共涉及268个基因,其中不同功能的GO分类780种,京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and ge-nomes,KEGG)通路67种,而贝叶斯因子>1、P≤0.001且误判率≤0.001的GO分类有94种,KEGG通路有6种,主要涉及应激反应、DNA损伤修复、细胞生理调控过程、细胞凋亡、免疫反应、细胞因子与细胞因子受体相互作用、Toll样受体信号通路、Jak-STAT信号通路以及MAPK信号通路相关.所涉及基因的蛋白产物通过在线String 9.0软件构建蛋白网络,运用Cytoscape 2.8.2软件将构建的蛋白网络图可视化及量化.筛出24个关键候选基因,包括STAT3、EGFR、NFKB1、GSTP1、IL4、IFNG、PARP1、MMP9、JUN、IL6、TNF、IL1B、CD4、CDH1、SMAD4、HRAS、PTGS2、EGF、VEG-FA、MLH1、TP53、CASP3、TGFB1和CCND1,其中5个关键基因是PTGS2、TNF、IL6、NFKB1和TP53.结论:胃癌患病风险关键基因可为胃癌遗传易感性研究提供参考,针对这些基因的大样本跨种族及高质量的临床研究可能是未来的方向.